Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms