Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
FXNQ16595 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
FXNQ16595 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FXNQ16595 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FXNQ16595 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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FXNQ16595 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FXNQ16595 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FXNQ16595 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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FXNQ16595 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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