Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS72Q15906 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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