Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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