Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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NECTIN1Q15223 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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NECTIN1Q15223 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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