Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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