Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms