Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
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