Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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