Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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ITGA9Q13797 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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ITGA9Q13797 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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ITGA9Q13797 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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ITGA9Q13797 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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ITGA9Q13797 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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ITGA9Q13797 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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ITGA9Q13797 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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ITGA9Q13797 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA9Q13797 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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