Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms