Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1SQ13698 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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