Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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