Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SKP2Q13309 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SKP2Q13309 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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SKP2Q13309 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SKP2Q13309 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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SKP2Q13309 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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