Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RLFQ13129 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RLFQ13129 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RLFQ13129 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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