Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms