Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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PTP4A2Q12974 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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