Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PTPRJQ12913 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PTPRJQ12913 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PTPRJQ12913 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PTPRJQ12913 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PTPRJQ12913 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPRJQ12913 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPRJQ12913 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPRJQ12913 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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