Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms