Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

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Length 949 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP1B1Q10567 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP1B1Q10567 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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