Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TFF3Q07654 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TFF3Q07654 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TFF3Q07654 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TFF3Q07654 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TFF3Q07654 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TFF3Q07654 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TFF3Q07654 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TFF3Q07654 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TFF3Q07654 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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