Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms