Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms