Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CREMQ03060 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREMQ03060 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREMQ03060 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms