Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms