Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms