Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms