Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UFM1P61960 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms