Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms