Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCDC1P59894 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms