Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA1P59665 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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DEFA1P59665 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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DEFA1P59665 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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DEFA1P59665 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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DEFA1P59665 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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DEFA1P59665 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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DEFA1P59665 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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DEFA1P59665 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA1P59665 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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