Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELLP55199 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELLP55199 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELLP55199 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms