Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23BP54727 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms