Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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PGGT1BP53609 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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PGGT1BP53609 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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