Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLCSP50747 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms