Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP153P49790 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP153P49790 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP153P49790 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP153P49790 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP153P49790 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP153P49790 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP153P49790 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP153P49790 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP153P49790 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP153P49790 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP153P49790 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP153P49790 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP153P49790 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP153P49790 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP153P49790 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP153P49790 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP153P49790 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP153P49790 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP153P49790 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP153P49790 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP153P49790 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP153P49790 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP153P49790 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms