Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms