Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTBP49356 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTBP49356 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNTBP49356 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNTBP49356 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNTBP49356 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNTBP49356 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTBP49356 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms