Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCCP43146 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCCP43146 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCCP43146 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCCP43146 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCCP43146 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCCP43146 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCCP43146 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCCP43146 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCCP43146 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCCP43146 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCCP43146 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCCP43146 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCCP43146 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCCP43146 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCCP43146 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCCP43146 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCCP43146 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCCP43146 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCCP43146 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCCP43146 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms