Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms