Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms