Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms