Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD1P28340 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms