Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms