Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD27P26842 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD27P26842 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD27P26842 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD27P26842 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD27P26842 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD27P26842 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD27P26842 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD27P26842 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD27P26842 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD27P26842 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD27P26842 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD27P26842 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD27P26842 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD27P26842 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD27P26842 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD27P26842 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD27P26842 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD27P26842 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD27P26842 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD27P26842 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD27P26842 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD27P26842 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD27P26842 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD27P26842 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD27P26842 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD27P26842 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD27P26842 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD27P26842 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD27P26842 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms