Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PTPRBP23467 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTPRBP23467 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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