Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms