Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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