Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms