Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms